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특무부대(task force)는 특정 작업을 수행하거나 특정 상황을 다루기 위해 만들어진 소인원으로 구성된 단체이다. (일반적으로 3 ~ 10 명이며, 20 명 이상의 특무부대의 전례가 없는 것은 아니다.) 각 특무부대에게는 그리스 문자와 숫자의 고유한 조합으로 할당되지만, 명칭은 보안시설과 같다.
기동특무부대 알파-2 (별명 "우체부"): 재단 기지 사이의 안전 및 유클리드 등급 물체 정기 수송을 감시 및 격리한다.
기동특무부대 알파-4 (별명 "조랑말 속달우편"): SCP-130이나 SCP-1020같은 공용 또는 개인 우편으로 보내진 변칙 화물을 추적 및 회수한다.
기동특무부대 알파-16 (별명 "마이크의 삼촌") SCP-746과 같은 단체를 찾아 민간인에게 드러나지 않도록 한다.
특무부대 알파-440 (별명 "이게 대체 무슨 소리야?") 재단의 모든 지부에서 직원과 공동 작업을 하는데, 재단 사건, 연구 작업, 운영의 음성 기록을 문서화하여 보관하는 일을 전담한다.
기동특무부대 베타-3 (별명 "테이크아웃 손님"): SCP-785 출몰 사건을 진압하고 완화시킨다.
기동특무부대 베타-7 (별명 "미췬 모자 장수"): 극심한 생물적 재해의 격리와 그 후 감염 구역의 위생 관리를 전담하고 있다.
기동특무부대 감마-5 (별명 "그들은 우리 편입니다!"): 대중에 역정보를 흘리며 피해 대책을 세운다. 현재 재단의 활동을 감추기 위해 여러 방송 매체에서 비밀리에 활동하고 있다.
기동특무부대 감마-6 (별명 "심해 먹이통"): SCP-169나 SCP-741같은 여러 해양 SCP를 격리하고 감시하는 일을 한다.
기동특무부대 델타-5 (별명 "선두 주자"): 숙적인 단체들이 잡기 전에 SCP를 추적해서 잡는 역할을 맡고 있다. 현재로써는 IRG의 요원들을 쫓고 있다.
특무부대 델타-9 (별명 "해커"): SCP-569-9 개체들을 격리하기 위해 41 기지에 영구히 배치되었다. SCP-567의 특성 때문에, 특무부대 델타-9의 요원들은 몇 가지 조건을 충족시켜야한다. 자세한 정보를 위해서는 SCP-567를 참고하시오.
기동특무부대 델타-8 (별명 "산파"): 정자은행을 감시하고 기부자들을 추적한다. 정상적인 정액을 가정하고 주어지는 비-인간적인 번식 물질을 파괴한다. 그들의 이름은 부가 기능과 관련되어 있는데, 그것은 수정을 막을 수 없을 때 행해진다. 현재로써는 SCP-███의 탐사와 관리에 관여하고 있다. SCP-231을 다루던 중 부대원 몇을 잃었으며 그 프로젝트 전에는 [데이터 말소]에 다시 파견되어 있었다.
기동특무부대 엡실론-9 (별명 "불을 먹는 자"): 현재 파견된 업무 없음. SCP-968의 습득 당시 극심한 장애를 얻었다.
기동특무부대 제타-9 (별명 "뒤쥐"): 스케일이 크거나 땅에서 움직이지 않는 SCP 물체를 탐험하고 회수하는 일을 맡고 있다. 현재로써는 SCP-184에 의해 영향 받은 지역을 탐사 중이다.
기동특무부대 에타-10 (별명 "악을 보지 말라"): 밈적재해 관련 포획, 조사, 격리를 전담하고 있다.
기동특무부대 세타-4 (별명 "정원사"): 식물을 기반으로 하는 SCP를 추적하고 격리하는 것을 전담한다.
기동특무부대 세타-5 (별명 "더 큰 보트"): 수생, 생물적 SCP를 격리하는 것과 바다에서의 이상한 포획물에 대한 소문을 추적하는 일을 하고 있다.
기동특무부대 요타-4 (별명 "꿈 사냥꾼"): SCP-932의 야생 개체를 발견하고 격리하는 일을 한다.
기동특무부대 요타-5 (별명 "호랑이 미끼"): 위험도가 높은 임무를 위해 만들어진 단체로 최대한 빠른 반응 속도를 필요로 한다. 현재 SCP-247-1의 개체를 추적하고 처리하는 일에 파견되어있다.
기동특무부대 요타-10 (별명 "빌어먹을 연방수사관"): 현지 연방수사국에 의한 SCP 관련 보고서를 막고 SCP 관련 조사를 방해하는 일을 맡는다.
정찰 부대 카파-6 (별명 "천사의 눈"): SCP-438 주변에 지어졌으며, 재단과 관련된 여러 스파이 프로젝트를 맡는다. 현재 기동특무부대 델타-5과 협력해 잠재적 SCP 물체를 추적하고 습득하는 일을 맡고 있다.
기동특무부대 카파-42 (별명 "러키세븐"): 세 명이 실종됨, 죽은 것으로 추정된다. 둘은 자살했으며 하나는 처리되었다.
기동특무부대 람다-2 (별명 "클레프 박사의 양성애자 여성 스트리퍼 암살대"): 차트에 나타나기는 해도 기동특무부대 람다-2는 아예 요원이 없는 것으로 드러났으며 어쩌면 존재하지 않을지도 모른다. 여기에서 그 존재는 미지수이다.
기동특무부대 람다-3 (별명 "주어진 별명 없음"): 현재 SCP-894-1, -2, -3의 개체를 추적하고 습득하는 일을 맡고 있다.
기동특무부대 람다-4 (별명 "조류 관찰자"): 현재 SCP-514를 추적하며 보호하고 있다.
기동특무부대 뮤-4 (별명 "디버거"): 컴퓨터와 전기를 기반으로 하는 SCP들을 회수, 격리, 처리하는 일을 맡고 있다.
기동특무부대 뮤-13 (별명 "고스트버스터즈"): SCP-460에 배치되었으며, 그 결과로 생긴 현상들을 추적하고 격리하는 일을 전담하고 있다.
기동특무부대 뮤-89 (별명 "몰록과 짐"): 언어학, 심리학, 전략적 협상법을 훈련받았다. SCP-089에 배치되었다.
기동특무부대 뉴-1 (별명 "원인과 결과적"): 확률, 기회, 사건조작에 관해 고도의 훈련을 받은 전문가들이며, 일시적 변칙 물체의 사용과 시간 여행 패러독스 분석 및 인과 관계의 법칙 이해를 담당하고 있다.
기동특무부대 뉴-6 (별명 "트리플독 데어데빌"): 어린아이나 청소년을 연상시키는 조작원들과 보조 직원으로 구성되어있다. 현재 SCP-1448의 추적과 격리에 파견되었다.
기동특무부대 크시-8 (별명 "창 사냥꾼"): 야생에서의 추적과 인지력, 장기 생존에 훈련된 전문가들로, 때에 따라 몇 달씩이나 바깥에서 살 때도 있다. 현재 SCP-778를 담당하고 있다.
기동특무부대 크시-11 (별명 "북극곰"): 북극 생존과 추적에 고도로 훈련된 전문가들. 현재 32 기지에 파견되었다.
무장 신속대응 특무부대 크시-13 (별명 "Sequere Nos" ["우리를 따르라"]): 소대 단위의 신속 대응 부서로, 거대한 스케일의 격리 절차나 탈주 가능성을 포함하나 그것으로 제한하지는 않는, 위협요소가 아직 밝혀지지는 않았지만 군사급 힘이 필요할 것 같은 위험하면서/위험하거나 변칙적인 상황을 담당한다.
정찰 특무부대 오미크론-6U (별명 "삼엽충"): SCP-850의 탐사 당시 바다에서 실종되었던 SCPS 삼엽충과 그 선원들.
기동특무부대 오미크론-9 (별명 "핫 구역 무용단"): 4등급 생물 재해 환경에서의 근접전에 특화됨.
신속 대응 특무부대 오미크론-11 (별명 "버크의 소년"): 전에는 SCP-444 격리 및 회수 임무를 맡고 있었다. 오미크론-11은 언어학적으로 옮겨 다니는 SCP를 격리하는 훈련을 받은 귀머거리 요원으로 구성되어있다. 오미크론-11은 여러 장소에 나뉘어 파견되었다.
기동특무부대 파이-1 (별명 "전형적인 도시인"): 세계에서 인구가 많은 지역의 잠재적 SCP 물체를 추적하고 격리하는데 특화되었다. 제28기지를 거점으로 하고 있다.
기동특무부대 로-1 (별명 "교수"): 관련 단체 알파-388, "알렉실바 대학"과 관련된 변칙적인 물체를 격리하고 수송하는 임무를 맡고 있다. 제38기지를 거점으로 하고 있다.
기동특무부대 로-5 (별명 "제때에 한 땀"): 시간 변칙 물체들을 고치기 위해 SCP-276에 파견되었다. 현재 빅토리아 시대 어딘가에 있다.
기동특무부대 로-8 (별명 "길가의 소풍객"): 물리 법칙이 지역적으로 변동된 구역을 탐사하고 탐험하는데 훈련되고 장비되어있다.
기동특무부대 로-1 (별명 "몬티주마"): 현재 [데이터 말소]의 늪지대에 파견되어있다. SCP-1099의 격리를 완수하는 임무를 맡고 있다. 실용적 생물 격리 상황에서 1등급 인원을 훈련시킨다.
특무부대 시그마-6 (별명 "경비행기"): 현재 SCP-120의 시설과 그 위치를 보호하며 유지하고 있다. ██ 사령부에 위치한 SCP-120 시설에 거주하는 지휘부서 하나와 방어 및 유지 부서로 구성되어 있다. 5개의 부서는 목표 지점에 거주하며, 5개의 보존 부서가 이것을 위해 있고, 다른 5개의 부서가 다른 SCP-120관련 프로젝트에 파견되었다.
기동특무부대 입실론-2 (별명 "소 조련사"): SCP-843을 맡고 있으며 SCP-843-2의 모든 야생 개체를 추적하고 파괴하는 임무 역시 맡고 있다.
기동특무부대 키-7 (별명 "스포트라이트 전문가"): 빛이 없을 때 성장하는 SCP 대상을 다루는데 특화되었다.
기동특무부대 프시-8 (별명 "소음기"): 지하와 지표 사이에 있는 모든 종류의 통신 수단을 찾아내며, 보통 파이프, 벨, 심지어 전화선 등의 실수로 묻힌 물품에 대한 주의 목적에서 파견되어 대상을 없앤다.
기동특무부대 오메가-7 (별명 "판도라의 상자"): 현재 SCP-076을 다루고 지원하고 있다. 최근, SCP-105가 이 부대로 발령되었다. 이 항목은 기록과 정보 보안 관리자의 명령으로 삭제됨.
기동특무부대 오메가-15 (별명 "발키리"): 스웨덴을 기점으로 하는 공중지원반으로, 북, 서 유럽에 빠르게 공중 지원을 공급하는 것을 맡고 있다. 현재 임무에는 재단 요원들이 SCP-526을 격리하는데 보조하는 것이 포함되어있다.
별동특무부대 O-23 (별명 "부엌 개수대"): O5 위원 중 몇몇이 만든 O-23은 항상 최전방에 서나 살아 돌아오는 연구원과 요원 여럿으로 구성되어있다. 모든 것이 실패하면, O-23을 들여보내라.